Sự khác biệt chính giữa Jawi và Pegon là phần sau hầu như luôn được viết bằng các dấu hiệu nào đó. Vì ngôn ngữ Java chứa nhiều aksara swara (dấu nguyên âm) so với đối tác Malay của họ, nên phải viết các dấu hiệu giọng nói để tránh nhầm lẫn. Ngoài tiếng Mã Lai, Tiếng Java cũng sử dụng một hệ thống chữ viết tương tự mà không có dấu hiệu giọng hát gọi là Gundhul.[cần dẫn nguồn]